发酵小叶苦丁的危害有：加重风湿性关节炎或者是风寒的病情，导致月经不调，加重肠道疾病症状。
发酵过后的小叶苦丁茶，虽然能够对机体进行调整和改善，但是长期大量的饮用有可能会使寒湿气排出受到影响，如果有类风湿性关节炎或者是风寒的情况，特别容易加重病情。
女士生理期处在失血过多情况，苦丁茶寒性，非常容易造成血气郁滞、月经难排，引起经痛，情况严重可导致月经不调。而有经痛身体素质的女士更应少喝。
刚刚生小宝宝的孕妇体质虚弱，苦丁茶不但不利生完孩子孑宫的修复，还会继续伤着肠胃，非常容易引起今后的腹部冷痛。如果脾胃比较虚寒，喝了之后很有可能造成腹胀以及拉肚子的情况。
